相对丰度计算公式

单个核苷酸频率很容易计算,Nt/N,Nt为单个碱基在序列中出现的次数。

二联核苷酸频率的计算P=Nw/(N-1),Nw为二联核苷酸在序列中出现的次数。

二联核苷酸相对丰度值就是Tij=Pij/(PiPj),其中Pi是单个核苷酸出现的频率,Pij表示二联核苷酸出现的频率。对于随机序列,且相邻两核苷酸相互独立,理论上Pij=piPj,也就是说相对丰度值应为1,所以1-Tij可作为序列对二联核苷酸偏性的测量。DRA反映了两个相邻碱基之间的相关程

通常用符号R表示。

定义为气体中轻组分的丰度C与其余组分丰度之和的比值。

其表达式是R≡C/(1-C)。

也可为质谱图中相对于基峰的离子峰度(从峰高计)。


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