DNA包括四种碱基,而且四种碱基之间遵循严格的配对规则:Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,Guanine(G,鸟嘌呤)一定与Cytosine(C,胞嘧啶)配对,反之亦然。碱基间的这种一一对应的关系叫做碱基互补配对原则。腺嘌呤与胸腺嘧啶之间有两个氢键,鸟嘌呤与胞嘧啶之间有三个氢键,即A=T,G≡C。
由于氢键不等于化学键,属于比较弱的结合,因此较低的能量就可以被打破。这样一方面保证了DNA能够发挥生物功能:如果结合很紧密,无法打开,那么也就不可能完成转录翻译等一系列生物功能。同时,这也意味着DNA很容易受到损伤,因为结合较弱,容易受到外界因素的干扰和破坏。
自然状态下,RNA都是单链,DNA都是双链。除此之外,组成RNA的单体是核糖核苷酸,组成DNA的单体是脱氧核糖核苷酸,两者区别之一是前者的五碳糖是核糖,后者的五碳糖是脱氧核糖,比前者少一个氧原子。区别之二是,RNA的碱基组成是A(腺嘌呤)、U(尿嘧啶)、C(胞嘧啶)、G(鸟嘌呤),而DNA的碱基组成是是A(腺嘌呤)、T(胸腺嘧啶)、C(胞嘧啶)、G(鸟嘌呤),两者差U和T。
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