、科属不同：二者同属于软骨鱼纲板鳃亚纲，但蝠鲼是燕魟目鲼科蝠鲼属，而鳐鱼是鳐形目鳐科鳐属。由于从目就不一样了，所以差异还是比较大的，可以看做两种不同的鱼类。
2、外形差异：蝠鲼的身体扁平，头部较宽，两侧有胸鳍分化而来的两个头鳍。胸鳍比较肥厚，如同翅膀一样。背鳍很小，尾巴又细又长，有的顶部还有一个或多个毒刺。牙齿又细又多，鳃孔宽大。鳐鱼的身体呈圆形或棱形，胸鳍很宽，从吻端一直扩伸到尾部，背鳍有两个。
3、分布不同：蝠鲼主要栖息在热带和亚热带的浅海地区，很少会停留在海底，一般从海岸附近的表水层到120米深的地方都能见到，我国在福建、浙江和黄海一带有发现。鳐鱼的分布范围则广泛的多，从热带到北极附近的水域都有，而且无论是浅海还是2.7千米深的地方也有分布，我国主要在东海和南海一带。
鳐鱼和魟鱼非常相象，因为它们都有扁平的身体。幼年的鳐鱼以生活在海底的动物如蟹和龙虾为食。当它们长大以后，主要猎捕乌贼等软体动物。捕食的时候，鳐鱼主要靠嗅觉捕猎。鳐鱼卧在海底时利用特殊的闭口呼吸法尽量避免吸入泥沙。鳐鱼在呼吸时，水通过头顶的管路吸入最后穿过腹面的腮裂流出。
分布于全世界大部分水区，从热带到近北极水域，从浅海到2700m以下的深水处，主要生活在东海和南海。日本的冲绳地区是鳐鱼的重要聚居地之一，当地政府已将其列为一个主要的参观景点，在那里的水族馆开设有专门的区域供人近距离观赏。
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