在处理案的过程中，雍正九年(1731年)，皇帝曾致函各省学生，表达对朝廷处理陆案的立场，赞同者签署声明，不赞同者则“各抒己见，使其自白，学政共奏，不容阻挠与隐瞒”(《子监档案？曾静派张卓去书案”)。在当时的恐怖气氛下，外省学生纷纷发表声明，称吕留良罪有应得。就在各省督抚先后奏起“各生归卫监，各有说法，无人有异言”(同上)时，浙江台州郡首府天台县(今浙江天台县)学生齐挺身而出，真正“独抒己见”。
起初，周华还和其他学生签署了一份保证书，保证法院杀死了吕留良，但事后，他总是感到愤愤不平。吕留良已经去世40多年了，这样一个有学问的人被杀害了！他抑制不住胸中的怒火，写了一折“在草稿中看到过孤独的表情”来为吕留良的罪行辩护。
稿子交给了县教务主任王元洲。王因为害怕伤害自己而拒绝提交。周华绥北上京师，到刑部告王元洲违反法令，阻止学生单独发表意见。刑司问其所以然，不想把情况搞得更糟，于是以齐岳级抗法被送回省里。浙江巡抚程元璋和吏部尚书帅年祖开导齐国放弃自己的主张，齐国坚持自己的主张。成和帅没有办法，只好把诬告王元洲的齐国关进了监狱。
仍不改朝换代，程、帅以诬告罪被判流放。在等待批准期间，福建和浙江省省长郝玉林视察了台州。齐国的听到这个消息后，派他的长子齐士去找郝申冤。郝玉林和程元璋一起把这件事告诉了朝廷，经过刑部讨论，皇帝批准了，就把齐押到了省城，关在那里，永远监禁。周华最终落入了雍正帝所谓的允许学者单独发表意见的陷阱。
周华在杭州的监狱里被关押了五年。他以为自己会在狱中老死，但雍正十三年(1735年)八月，死了，新即位的乾隆皇帝，大赦天下，齐也被释放了。
出狱后，齐在家住了六年，但他的胸膛还是抬不起来。他于乾隆六年(1741年)离家出走，走遍天下，最后住在武当山修道。这期间，他并没有超脱于世。因案被贬至陕西省长安县(今陕西省市)方明畴家中，自称与方同流合污。临走时写了一首《长安访方明畴》诗，诗中“往事不堪回首，我臂如螳螂！”可以看出，他仍然无法忘记吕留良一案。
建安二十一年(1756年)，齐的长子齐世新奉祖母之命，到武当山接他回家。他结束了十年的道士生涯，回到了家乡天台。从那时起，人们就看到齐变得乖张无理。
乾隆二十六年(1761年)，齐把他以前写的《独白与戏稿》和他的生平著作，以及别人的赠礼，送到杭州，请写信人出版。为了筹集刻书资金，他提出变卖家产，被妻子和儿子多次劝阻。他愤怒地抛弃了妻子和儿子，独自一人住在离城市二十英里的乡下。因为被妻子嫌弃子女，诬告亲戚邻居，族长齐长庚到县衙请愿，要求将他逐出宗族。周华立即做出了强烈的反击。他起诉:70岁老伴，通奸，“好几个人都结婚了”；长子齐士信、次子齐石闻下毒殴打；罗志的家人正在大肆指责他。这些明显是根据空编造出来的话，当然没有给自己的亲人和宗族带来损失，反而让人觉得齐周华奇形怪状，近乎精神错乱。
乾隆三十二年(1767年)，齐国的周华又做出了令人震惊的举动，断送了自己的性命。当年10月24日(1767年12月13日)，浙江巡抚熊来天台县视察仓库，拦住他的轿子，以请他作序为名，赠送他的《名山集第一集》、《学步随笔》、《独立意见稿》一份等书。此外，他提交了一份请愿书，指控他的妻子和他的表弟祁萱通奸。熊在他的书里看到“许多话是矛盾的和荒谬的”(《子狱档案？苏彭奏齐书《谋反与审折》)，立即带人到其住处搜查，缴获《名山集二》、《华阳子诗稿》等十二种书籍。熊扣留了齐进行审讯，并将此事报告了乾隆皇帝。
乾隆三十二年(1768年1月14日)十二月七日，乾隆皇帝下诏，将齐处死，其子齐世新、齐、孙其传、齐传荣依法应斩。为了从宽处理，他们被判监斩，即秋后处决。他的五个妻子，年幼的孙子也被作为奴隶支付给英雄的家人，他们所有的家庭财产都丢失了。此案牵连的李富、谢济世虽已去世多年，但也曾被抢；同时，包括鲁夫在内的20多人受到了处罚。方明畴和齐谈得很好，从重处罚，被发配到伊犁(今新疆)，让种地的士兵奴役。
周华的怪诞反常有两种可能性。第一，可能是第一次入狱后，精神冲击太大；出狱后，他周游世界，见尽人间裸体，导致心态失衡。第二种可能是他故意假造大象。从他去熊“自言自语”时附上反对亲戚、宗族、邻里的请愿书来看，可能是想让官方认为他与任何人都没有关系，所以如果得罪了，也不应该有人因为他的命运而有罪。那么他以前对他的妻子、儿子和堂兄弟所做的一切很可能是为了疏远他们，给世人留下齐周华与这些人无关的印象。
如果齐真的是装得奇形怪状，所以他伪造了自己的形象，他的苦心实在令人钦佩。但他的后代无论如何也没有逃出清朝统治者的魔掌，他被全家灭族。
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